ญี่ปุ่นตกอยู่ในความตื่นตระหนกหลังจากเรือหลายลำจมใกล้เกาะโอโดะ ในไม่ช้า คณะสำรวจที่นำโดยดร.เยมานีก็ค้นพบบางสิ่งที่ร้ายแรงเกินกว่าจะจินตนาการได้ ในรูปของสัตว์ประหลาดสูง 50 เมตร ซึ่งคนพื้นเมืองเรียกว่าโกจิรา ตอนนี้สัตว์ประหลาดเริ่มออกอาละวาดซึ่งขู่ว่าจะทำลายไม่เพียงแต่ญี่ปุ่นเท่านั้น แต่ยังรวมถึงส่วนอื่นๆ ของโลกด้วย

นักบินสอดแนมตกปลาสองคนค้นพบสิ่งที่น่าสยดสยองเมื่อพวกเขาเผชิญหน้ากับก็อดซิลล่าตัวที่สองพร้อมกับสัตว์ประหลาดตัวใหม่ชื่อแองกิรัส หากไม่มีอาวุธที่ฆ่าต้นฉบับได้ เจ้าหน้าที่ก็พยายามล่อลวงก็อดซิลล่าให้ออกไปจากแผ่นดินใหญ่ แต่ในไม่ช้า Anguirus ก็มาถึง และสัตว์ประหลาดทั้งสองก็มุ่งหน้าสู่โอซาก้าในขณะที่ญี่ปุ่นเตรียมรับมือกับโศกนาฏกรรม

ปี 1890, Matthew Burke (Roy Roberts) คู่หูเจ้าของธุรกิจพิพิธภัณฑ์หุ่นขี้ผึ้งคิดทรยศโปรเฟสเซอร์ Henry Jarrod (Vincent Price) เจ้าของร่วมอีกคนในการเผาพิพิธภัณฑ์หุ่นขี้ผึ้งเพื่อเอาเงินประกัน โปรเฟสเซอร์ Jarrod ศิลปินมือเอกพยายามสุดขีดที่จะรั้งผลงานหุ่นขี้ผึ้งของตนเองไว้ แต่มันก็สายเกินไปเมื่อมันแผดเผาเขาเข้าไปในกองเพลิงแห่งความแค้น...

เมื่อคณะทีมสำรวจได้เดินทางเข้าสู่ป่าลึกแถบอะเมซอนเพื่อทำการค้นคว้า จากนั้นจึงได้พบกับเจ้าปีศาจสุดสะพรึงตนนี้ที่โผล่ขึ้นมาจากหนองน้ำเพื่อฆ่าชีวิตทุกคน...