故事讲述了西历2067年，在人类会失去自我并泼辣化的怪病——“狂暴化症候群”蔓延的银河边境之地。而作为对抗手段而结成的战术音乐组合「WALKÜRE」为了以歌声平定“狂暴化症候群”——她们在星球间奔走、展开着现场演唱会活动。同时在另一方，被称为「空中骑士团」的「风之王国」所属瓦尔基里部队开始了举动。围绕着史前文化遗产之谜，超越星系的热烈团队协作与爱情故事拉开了帷幕……

故事发生在宇宙世纪 0079 年 1 月 23 日，吉恩与地球联邦间一决雌雄的战争，终于在 SIDE 5 鲁姆爆发。在战争中被逼入绝境的吉恩，手中握有秘密武器。就是用人型兵器“MS”所组成的特别突击大队，让战况一举逆转并大获全胜。 当中，隶属吉恩军的夏亚・阿兹那布尔，驾驶着“扎古Ⅱ”立下战积并因此晋升为少校，更获得“红色彗星”的别名。而在鲁姆会战后，地球联邦军策画了对抗吉恩军的＂V 作战＂。远在 SIDE 7 的少年阿姆罗・雷，自行动身去找寻新兵器“敢达”的秘密。另一方面，在地球的南极大陆，吉恩及地球联邦两军间和平谈判的场合，某项声明却从月神二号向全世界发出……。

TV动画与OVA系列的120分钟总集篇