อีวานเกเลียน:2.22 พัฒนาต่อไป (ไม่) ได้

มิซาโตะและวิลเลอ กลุ่มต่อต้านเนิร์ฟเดินทางมาถึงปารีสที่กลายเป็นสีแดงเพราะผลจากแกนกลาง ลูกเรือกลุ่มหนึ่งของวุนเดอร์ลงจอดบนซากปรักของหอกักกัน พวกเขามีเวลาเพียง 720 วินาทีในการฟื้นฟูเมืองขึ้นใหม่ เมื่อกองทัพอีวาของเนิร์ฟปรากฏตัว อีวาหมายเลขแปดของมาริตจึงต้องออกมารับมือ ขณะเดียวกัน ชินจิ อาสึกะ และเรย์ก็ออกเดินทางไปทั่วญี่ปุ่น

เกิดหายนะรุนแรงจากเซคันด์อิมแพกต์ เทวทูตที่สี่โจมตีโตเกียวที่ 3 และชะตากรรมของมนุษยชาติตกอยู่ในมือของเนิร์ฟ องค์กรรัฐบาลพิเศษ ชินจิ อิคาริ เด็กหนุ่มวัย 14 ปีถูกบังคับให้นำอีวา-01 เขากับเรย์ อายานามิ ผู้ขับอีวา-00 ได้รับคำสั่งให้ต่อสู้ แต่อีวา-01 เสียหายหนักเมื่อเทวทูตตนที่หกปรากฏตัว มิซาโตะ คัทสึรางิวางแผนรวบรวมพลังงานไฟฟ้าทั้งหมดของญี่ปุ่นมาไว้ในปืนลำแสงโพซิทรอนเพื่อเอาชนะเทวทูต

ผ่านไป 14 ปี ชินจิตื่นขึ้นมาบนเรือรบเอเอเอ วุนเดอร์ขององค์กรต่อต้านเนิร์ฟที่ก่อตั้งโดยอดีตสมาชิกของเนิร์ฟ ชินจิได้ยินเสียงของเรย์ดังมาจากอีวามาร์ค 09 ที่ถูกส่งมาช่วยเขา เขาจึงหนีออกจากวุนเดอร์และมุ่งหน้าไปยังเนิร์ฟ คาโวรุ นางิสะพาชินจิไปดูดินแดนที่กลายสภาพ เขาจึงได้รู้ว่าการช่วยชีวิตเรย์ส่งผลให้เกิดเนียร์เธิร์ดอิมแพกต์ที่ทำลายล้างโลกอย่างราบคาบ

หลังจากพบหน้าศัตรูตัวจริง ซึ่งเป็นคนที่เกี่ยวข้องกับอากิโตะและเป็นผู้รับผิดชอบต่อการสังหารกิอัสที่สั่งสมมา W-0 จึงพยายามเดินทางกลับฐานที่ปราสาทไวส์วูล์ฟ อย่างไรก็ตาม เนื่องจากต้องติดอยู่ที่วอร์ซอเนื่องจากปัญหาเรื่องการระบุตัวตนทางทหาร พวกเขาจึงถูกบังคับให้ยอมรับความช่วยเหลือจากยิปซีในท้องถิ่น ทำให้ทีมมีเวลาสร้างสัมพันธ์ที่แน่นแฟ้นขึ้น ระหว่างนั้น จูเลียส คิงส์ลีย์ ที่ปรึกษาชาวอังกฤษและซูซาคุ คุรุรุกิ ผู้คุ้มกันของเขาเริ่มทำงานร่วมกับอัศวินแห่งเซนต์ไมเคิลเพื่อปราบกองกำลังต่อต้านของยุโรปให้สิ้นซาก โดยใช้อาวุธขนาดยักษ์ที่เรียกว่ากองเรืออาร์คเป็นอาวุธทำลายล้าง

กองเรืออาร์คถูกทำลาย และกองกำลังของศัตรูจำนวนมากถูกกวาดล้างเนื่องจากการลงจอดฉุกเฉิน ในขณะที่กองกำลังที่เหลือของ Holy Order of Michael รวบรวมกำลังกันใหม่เพื่อเริ่มการโจมตีครั้งสุดท้ายที่ปราสาท Weiswolf หน่วย wZERO พร้อมด้วยพันธมิตรใหม่ Ashley Ashra เตรียมพร้อมที่จะสกัดกั้นพวกเขา ในขณะเดียวกัน เมื่อ Geass ของเขาหลุดจากการควบคุม Shin ก็เริ่มดำเนินการลบการมีอยู่ของน้องชายของเขาให้สิ้นซาก แต่ Akito ซึ่งสัญญากับ Leila ว่าเขาจะกลับมามีชีวิตอีกครั้ง ปฏิเสธที่จะยอมรับชะตากรรมดังกล่าว และทั้งสองก็ปะทะกันในการต่อสู้ครั้งสุดท้าย

ในขณะที่ W-0 ไม่อยู่ เลอิลาและลูกเรือที่เหลือในฐานพบว่าพวกเขาถูกล้อมรอบโดยอัศวินร้ายแห่งบริตตัน ชิน ฮิวงะซึ่งขับยานเวอร์ซิงเจทอริกซ์ เป็นผู้นำการโจมตีของศัตรู โดยชิงตำแหน่งแกรนด์มาสเตอร์ของอัศวินแห่งเซนต์ไมเคิลมาครอง เมื่อสมาชิกหลักของเธอไม่พร้อม เลอิลาจึงต้องปกป้องเพื่อนร่วมทีมของเธอ แต่เรื่องนี้อาจจะยากกว่าที่เธอคิดมาก เพราะสายลับที่แอบซ่อนอยู่ท่ามกลางพวกเขาในที่สุดก็พร้อมที่จะเปิดเผยตัวตนแล้ว เมื่อไม่มีทางเลือกอื่นนอกจากต้องยอมจำนน เลอิลาจึงนัดพบกับชินเพื่อให้แน่ใจว่าทีมของเธอจะปลอดภัย แต่เมื่อการเจรจาเริ่มล้มเหลว อากิโตะและพันธมิตรที่ไม่คาดคิดก็กลับมาในเวลาที่เหมาะสมเพื่อพลิกสถานการณ์

สงครามระหว่างยูโรบริทันเนียและสหภาพยุโรปยังคงดำเนินต่อไป คำสั่งใหม่ถูกมอบให้กับหน่วย W-0 ให้ลงจอดในดินแดนของศัตรูเพื่อเบี่ยงเบนความสนใจ นักบินของหน่วย W-0 ประกอบด้วยผู้บังคับบัญชา เลอิล่า ชาวญี่ปุ่นคนเดียวที่รอดชีวิตจากการต่อสู้ครั้งสุดท้าย อากิโตะ และสามคนที่หลบหนีจากเกตโตทั้งสิบเอ็ดและอาศัยอยู่ในโลกใต้ดิน เรียว ยูกิยะ และอายาโนะ ทุกคนต่างคาดหวังในภารกิจของตน ปฏิบัติการจึงดำเนินต่อไป ในอีกด้านหนึ่งของยูโรบริทันเนีย ชิน ผู้ทำให้ผู้มีพระคุณของเขาฆ่าตัวตายด้วยพลังลึกลับของ "กีอัส" ได้รับการแต่งตั้งให้เป็นผู้นำของอัศวินแห่งเซนต์ไมเคิล ขณะที่ชินค่อยๆ ก้าวหน้าเพื่อความทะเยอทะยานของตัวเอง เขาและผู้ใต้บังคับบัญชาในหน่วยอาชูระก็ได้รับคำสั่งให้ไปประจำการ คนหนึ่งอยู่เพื่อต่อสู้ และอีกคนต่อสู้เพื่อมีชีวิตอยู่

เรื่องราวเกิดขึ้นหลายปีหลังจากแผน "Zero Requiem" ของลูลูช เขายอมสละชีวิตเพื่อช่วยโลกและปกป้องคนที่เขารัก วันที่ลูลูช วี บริททันเนียล่มสลายเป็นวันที่โลกที่แตกสลายไปด้วยสงครามแห่งนี้พบกับความสงบสุข ขณะนี้ ขณะที่เพื่อนๆ ของเขาพยายามรักษาความสงบ การโจมตีของผู้ก่อการร้ายอาจเสี่ยงทุกอย่าง นักวางแผนผู้ชาญฉลาดสามารถเอาชนะความตายและช่วยพวกเขาทั้งหมดได้หรือไม่ หรือว่ามรดกของลูลูชจะตกไปอยู่ที่นี่?