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草薙素子之后，巴特与侦探出身的陀古萨结为搭档。近期发生多起机器人偶杀害主人继而自杀的事件，由于受害者家属均无公诉，且死者中有政客与公安官员，于是公安9课派出巴特小组调查此案。杀人人偶皆为荒凉地带公司出品的哈德莉机型，应部分顾客要求，该机型同时具备异性玩伴的功能，巴特从荒凉地带公司出货官遇害入手，卷入与黑帮的战斗，期间有人入侵他的大脑，使其自残。巴特决定直奔荒凉地带总部，他与陀古萨拜访了择捉岛上的黑客基姆，后者布下系统陷阱，幸有素子提出警告避免陀古萨陷入控制。依靠基姆这条线索，巴特登上了荒凉地带公司设立在海上的工厂船，素子再次降临他的身边，与其并肩作战。

公元2029年，未来世界是高科技与信息化的世界。人类生活水平的提高伴随着犯罪活动的高科技化，于是，专门镇压高科技犯罪的特殊部队——公安9课成立了。队长草薙素子，作为一位全身“义体化”的女警，带领公安9课不断展开行动。是次，公安9课帮助公安6课秘密解决了一位程序员外逃他国的麻烦琐事，又卷入传说中的黑客“傀儡师”的犯罪事件。当行动陷入僵局之际，傀儡师竟然不请自来，出现在公安9课！素子与她的战友们，不知不觉地被卷入了一场涉及政府的阴谋之中。本作根据1995年动画电影《GHOST IN THE SHELL》改编，系剧情不变、画面完全重制的作品。

一位普通白领青年（田口智朗饰）在地铁站被手上有着铁爪的神秘女人（叶冈伸饰）袭击追杀。一番打斗后返家，他在色情幻想中发现自己的身体竟正在钢铁化，下身变为巨大的钻头，拥有了极其可怕的力量，他的女友（藤原京饰）成为了变身的祭品，而他最终变为一个金属的怪物。这时来历不明的男子（冢本晋也饰）出现，原来他在青年造成的车祸中大难不死，并因此获得超能力，他的憎恨力量导致了以上所有事情的发生。一个由钢铁打造的躯体，一个神秘的超能力者，他们将展开可怕的对决。

这是一部极具创意的浪漫喜剧解构，围绕着这个问题展开：如果你能回到你所爱的人的过去，治愈他们的创伤，解决他们的问题，并把他们变成完美的伴侣，你会怎么做？

自20世纪70年代开始，美国政府实施了名为SETI的计划，30年来不间断的用射电望远镜扫描宇宙空间，旨在寻找外星生物和相关文明。在犹他州的德威市，有一所隶属政府的实验室，这里正在进行一项秘密试验。在此之前，人类曾受到外星文明发回的信息，其中包括外星生物的DNA组成和生命重组的方法。犹他州实验室的科学家们利用外星人提供的资料培养出拥有外星人DNA的新人类“塞尔”。出于某种原因，政府决定中止这项实验，但其中一个塞尔却逃出实验室。她将给人类带来怎样的影响？ 　　本片荣获1996年MTV电影奖最佳银幕之吻奖、1995年科环宇宙杂志最佳化妆奖、1995年Sitges-Catalonian国际电影节最佳特效奖。

故事以爆发了“全球同时违约”经济危机的2045年为背景，素子、巴特等九课的成员加入雇佣兵组织以“GHOST”的名义行动。然而，因为一个阴谋，公安九课再度集结。

在人类灭绝后，一颗卫星和一个浮标在网上相识并展开不寻常爱情。

承受着残酷命运的少女露恩•芭洛特与强敌鲍伊德进行着实力悬殊的惨烈战斗，危急时刻，号称万能兵器的犯罪搜查官乌夫库克博士出现，拯救了濒临死亡的芭洛特。当芭洛特再次醒来，发现自己正置身于传说中的禁忌科学诞生之地——“乐园”实验室，再次她见识了许多奇怪的发明，并了解到“乐园”和三博士的过去。经过一番追查，她终于得知榭尔的记忆正藏在卡西诺赌场的一枚筹码之中。为了追查榭尔的过去，芭洛特化装成赌客走入凶险的赌场……